خلية ضمان الجودة هي هيئة دائمة تابعة مباشرة لقيادة المؤسسة (مدير جامعة أو مدير مدرسة عليا) تُكلَّف بإدارة وتنظيم كل الأنشطة المتعلقة بتحسين الجودة وترسيخ ثقافتها داخل المؤسسة. تتكون الخلية من منسق وأعضاء يمثّلون مختلف الأقسام والهيئات، وتشرف مركزيا على تطبيق المرجع الوطني لضمان الجودة وأنظمة إدارة الجودة المعتمدة. وتضطلع بوظائف التقييم الذاتي الداخلي، وجمع وتحليل المعطيات حول الأداء البيداغوجي، والبحثي، والإداري، والحياة الجامعية. كما تتولى اقتراح ومتابعة مشاريع تطوير الجودة، والتحضير للتقييمات الخارجية، وإعداد التقارير الدورية الموجهة للإدارة والهيئات الوطنية. وبذلك تُعد الخلية الأداة المؤسسية التي تضمن استمرارية التحسين، وتحويل مبادئ الجودة من شعارات عامة إلى ممارسات وإجراءات ومنظومة مؤشرات قابلة للقياس.